首先，“上五休二”是指一周工作五天，休息两天的工作模式。这种工作制度在很多企事业单位中已经普遍推行，尤其是在一些公共服务行业中。对于公务员而言，他们的工作时间安排通常会根据国家的相关规定和地方的具体执行情况而有所不同。

南京市作为江苏省的省会城市，其公务员的工作制度也遵循国家的基本规定。根据《中华人民共和国公务员法》的相关条款，公务员的工作时间和休息休假应当符合国家统一的规定。具体到南京，大多数公务员确实实行的是标准的“上五休二”工作制，即周一至周五为工作日，周六和周日为休息日。

不过，需要注意的是，公务员的工作性质决定了他们在某些特殊时期可能需要加班或值班。例如，在重大节假日期间或者遇到突发事件时，部分公务员可能会被安排加班以确保公共服务的正常运行。但这并不意味着他们完全打破了“上五休二”的基本框架，而是属于临时性的调整。

此外，南京市政府也会根据实际情况对公务员的工作制度进行适当的优化和调整。比如，为了提高工作效率和服务质量，可能会推出弹性工作制等灵活安排。这些措施旨在更好地平衡工作与生活的关系，同时也体现了政府对公务员福利的关注。

总的来说，南京公务员的工作制度总体上是按照“上五休二”的标准执行的。当然，具体的安排还需结合个人岗位职责以及单位的实际需求来确定。如果你对这方面有更深入的兴趣或疑问，可以查阅相关法律法规或咨询当地政府部门获取权威信息。